A Cátedra organiza-se em torno de quatro grandes eixos interdisciplinares:
Ecologia Integral e Sustentabilidade
Estudo e promoção de formas integradas de cuidado com a Casa Comum, aliando meio ambiente, dignidade humana e justiça social.
Justiça Social e Políticas Públicas
Análise de desigualdades e desenvolvimento de práticas e políticas que promovam inclusão, equidade e acesso a direitos fundamentais.
Cultura do Encontro, Educação e Diálogo
Reflexão sobre convivência pacífica, pedagogias da escuta, reconciliação e práticas educativas inspiradas pelo Pacto Educativo Global.
Economia de Francisco e Clara
Investigação e estímulo a modelos econômicos alternativos baseados no bem comum, solidariedade, cooperação e justiça climática.